Kapan jelasnya proses penggabungan kedua wilayah tersebut tidak ada yang tahu, namun yang jelas penggabungan kedua wilayah tersebut berdasarkan Rembug/Musyawarah
Data yang kami miliki tentang sejarah Desa Ngebong adalah PETA DESA yang dibuat pada jaman penjajahan Belanda yang bertuliskan dengan “GOUVERMENT DOST JAVA” tahun 1913.disana tertulis Kepala Desanya adalah WIRJONTONO.
Pada jaman dulu Pemerintahan Desa tidak mempunyai Kantor/Balai Desa.Jadi setiap Lurah/Kepala Desa mempunyai rumah yang besar yang disebut BALE/RUMAH LIMAS/JOGLO yang dijadikan sebagai tempat Pertemuan.disana juga terdapat Kentongan besar sebagai alat komunikasi.
Pada perkembangannya pada tahun 1978 di Desa Ngebong didirikan Kantor Pemerintahan/Balai Desa sebagai pusat pemerintahan desa.
Balai Desa tersebut dibangun di atas lahan/Tanah Kas Desa yang terletak di Dusun Krenggan.
Balai Desa tersebut didirikan pada masa pemerintahan Kepala Desa SUHUD EDI SISWOYO.
Adapun Kepala Desa Ngebong yang pernah memerintah di Desa Ngebong adalah sebagai berikut :
- RONOMEDJO tahun s/d 1906
- WIRJONTONO tahun 1906 s/d 1941 (ayahnya Sadak)
- SADAK tahun 1942 s/d 1970
- SUHUD EDI SISWOYO tahun 1971 s/d 1989
- SUPIJAH tahun 1990 s/d 2006
- SUBRIYANTO tahun 1999 s/d 2013
- ROHMAD tahun 2013 s/d sekarang